En cuanto a control de calidad, estamos trabajando con control interno diario de tres niveles para hematología, coagulación, hormonas, marcadores tumorales e infecciosas, dos niveles para Química sanguínea y para uro análisis y coproanálisis. Para el control externo, con corrimiento mensual para lo concerniente a Química Clínica, Hematología, Coagulación y Hormonas desde el año de 1997. Todos los anteriores controles, de la casa comercial LabCare de Bogotá con el apoyo de Riqas Internacional de Inglaterra y MLE. Además, este programa cuenta con programas bimensuales de asesoría de seguimiento a la calidad con la empresa ACG de la doctora Alba C Garzón.

Para los programas de microbiología, uroanálisis, coproanálisis y enfermedades infecciosas, trabajamos con control externo de Api. Actualmente, el Sistema de Gestión de Calidad del Laboratorio, basado en la Norma Técnica Colombiana ISO 9001 versión 2015 se encuentra certificado por el ICONTEC. Certificado N° SC-CER 105537 con modificación el 06 de octubre del 2022, ultima auditoría externa en noviembre de 2024 y vigencia hasta el 28 de noviembre de 2025. En proceso de certificación se encuentran las normas NTC OHSAS 18001 y la norma NTC-ISO 14001.